Ingra Morales Claro, Ester Sabino y Nuno R. Faria, Universidad de São Paulo, Faculdade de Medicina, Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, São Paulo, SP, Brasil.
Investigadores de la Universidad de São Paulo (USP, São Paulo, Brasil), Instituto de Enfermedades Infecciosas Emílio Ribas, Secretaría de Salud del Estado de São Paulo (Brasil), Universidad de Edimburgo, Universidad de Birmingham, Imperial College de Londres y la Universidad de Oxford, Reino Unido, informan un genoma casi completo del primer caso confirmado de viruela del mono detectado en Brasil, recolectado el 7 de junio de 2022 en el Instituto de Enfermedades Infecciosas Emilio Ribas, de un paciente masculino de 41 años y con antecedentes de viajes recientes a Portugal y España. El artículo Shotgun metagenomic sequencing of the first monkeypox virus case from Brazil, 2022 fue publicado en Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, vol. 64.
El virus de la viruela del mono (MPXV) es un virus de ADN zoonótico de doble cadena con un genoma de 197 kb, miembro del género Orthopoxvirus (OPV) y de la familia Poxviridae, que también incluye el virus de la viruela que causa la enfermedad del mismo nombre. Nombre. La clasificación genómica se divide en 2 clados, denominados el clado “África occidental” y el clado “África central” o “Cuenca del Congo”. Sin embargo, una nueva clasificación propuesta muy recientemente dividió el MPXV en 3 clados distintos (1-3). El clado 3 contiene la mayoría de los genomas de brotes humanos de 2017 a 2022, con su diversidad denotada por linajes neutrales como A a B.1 (Happi, et al, 2022).
El MPXV se identificó por primera vez en un niño de 9 meses en 1970 en la República Democrática del Congo y desde entonces ha sido responsable de causar varios brotes de viruela del mono informados en el continente africano (Bunge, et al. 2022). A principios de mayo de 2022, se detectaron casos de MPXV en el Reino Unido y Portugal, la mayoría sin antecedentes de viajes conocidos a países endémicos.
Imagen: autores.
Figura 1. Filogenia de máxima probabilidad con 103 secuencias genómicas completas, incluidas 102 disponibles en NCBI GenBank al 9 de junio de 2022. Los genomas destacados (puntas amarillas), incluido el SP01 descrito en este estudio (punta roja), pertenecen al linaje B.1 propuesto recientemente.
Hasta el 9 de junio de 2022, se han confirmado 1.240 casos en 33 países de todos los continentes, la mayoría en países europeos y Estados Unidos, con dos casos de MPXV de América del Sur notificados en Argentina y 8 casos sospechosos de viruela en Brasil. estados de Santa Catarina, Ceará, Mato Grosso do Sul, Rio Grande do Sul, Rondônia y São Paulo.
Al secuenciar mediante un enfoque metagenómico de shotgun, utilizando la tecnología Nanopore, el hisopo de piel de las lesiones (vesícula y costra) del caso sospechoso, investigadores del Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, Brasil, identificaron 3 SNP únicos en el primer genoma MPXV caso de Brasil, en comparación con el genoma actualizado de los CDC de EE.UU. Demostraron que el primer caso de MPXV de Brasil se agrupaba dentro del linaje B.1 propuesto recientemente (Happi, et al, 2022) y estaba estrechamente relacionado con las secuencias de Portugal, Alemania, EE. UU. y España.
También evaluaron si los primers de diagnóstico de RT-qPCR recomendados eran adecuados para la identificación del genoma del virus recién secuenciado mediante la investigación de presuntos desajustes en los sitios de unión de primers y sondas para los conjuntos de detección genéricos MPXV y B.1 MPXV específicos. El análisis mostró que es poco probable que las mutaciones encontradas afecten la sensibilidad de este conjunto de primers, lo que indica que los primers existentes pueden detectar infecciones del brote actual.
Ahora tenemos más de 4.000 casos confirmados de MPXV en 47 países, y Brasil ya registró 14 casos confirmados, tres de ellos autóctonos. Los autores enfatizan que este estudio destaca la importancia de confirmar el diagnóstico a través de una técnica de secuenciación rápida y confiable y vigilancia genómica de MPXV para una mejor comprensión de la epidemiología, patrones de transmisión, evolución del virus y su adaptación a la transmisión humana, y evaluación de métodos de diagnóstico de laboratorio.
Referencias
BUNGE, E.M., et al. The changing epidemiology of human monkeypox: a potential threat? A systematic review. PLoS Negl Trop Dis. [online]. 2022, vol. 16, e0010141 [viewed 29 June 2022]. https://doi.org/10.1371/journal.pntd.0010141. Available from: https://journals.plos.org/plosntds/article?id=10.1371/journal.pntd.0010141
HAPPI, C., et al. Urgent need for a non-discriminatory and non-stigmatizing nomenclature for monkeypox virus. Virological.org [online]. [viewed 29 June 2022]. Available from: https://virological.org/t/urgent-need-for-a-non-discriminatory-and-non-stigmatizing-nomenclature-for-monkeypox-virus/853
Para leer el articulo, acesse
CLARO, I.M., et al. Shotgun metagenomic sequencing of the first monkeypox virus case from Brazil, 2022. Rev Inst Med Trop S. Paulo [online]. 2022, vol. 64, e48 [viewed 29 June 2022]. https://doi.org/10.1590/S1678-9946202264048. Available from: https://www.scielo.br/j/rimtsp/a/4K5czBsGKDtzbCS6wDhKLSj/?lang=en
Enlace externo
Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo – RIMTSP: https://www.scielo.br/j/rimtsp/
Traduzido del original en inglés por Lilian Nassi-Calò.
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